Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms