Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms