Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms