Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms