Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms