Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms