Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ccdc7bE9Q9Y3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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