Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms