Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms