Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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BC051665E9Q623 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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BC051665E9Q623 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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BC051665E9Q623 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC051665E9Q623 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BC051665E9Q623 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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