Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DspE9Q557 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DspE9Q557 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DspE9Q557 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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