Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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NbasE9Q411 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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NbasE9Q411 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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