Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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