Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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Ccdc171E9Q1U1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Ccdc171E9Q1U1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Ccdc171E9Q1U1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Ccdc171E9Q1U1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Ccdc171E9Q1U1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Ccdc171E9Q1U1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Ccdc171E9Q1U1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Ccdc171E9Q1U1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms