Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms