Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms