Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc1E9Q043 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms