Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20425E9Q035 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms