Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5415E9PXF3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms