Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srp54bE9PXC0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms