Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sfta2E9PXB6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms