Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc62E9PVD1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms