Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms