Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim12cD3Z3L3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim12cD3Z3L3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms