Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm5930D3Z257 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5930D3Z257 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms