Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms