Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6685D3YYP3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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