Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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