Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms