Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms