Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms