Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms