Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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