Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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