Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms