Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms