Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5483B2RV77 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms