Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms