Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usf3B2RUQ2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usf3B2RUQ2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usf3B2RUQ2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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