Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms