Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms