Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms