Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NhsB1AV60 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NhsB1AV60 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NhsB1AV60 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NhsB1AV60 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NhsB1AV60 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NhsB1AV60 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NhsB1AV60 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms