Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms