Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms