Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F6

Ttll13, Tubulin polyglutamylase TTLL13, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll13A4Q9F6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll13A4Q9F6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms