Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf2A3KGV1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms