Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt1lA2RSY6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms