Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trgv2A2J008 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trgv2A2J008 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms