Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samt1A2BED8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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